کارمزد سبدگردانی در شرکت‌های سبدگردان شامل دو بخش “کارمزد ثابت” و “کارمزد متغیر” است.
کارمزد ثابت مطابق با دستورالعمل سازمان بورس و اوراق بهادار درصد ثابتی از مجموع ارزش اوراق بهادار موجود در سبد هر مشتری است که در هنگام انعقاد قرارداد سبدگردانی در خصوص آن مابین شرکت سبدگردان و مشتری توافق حاصل می‌گردد. این کارمزد در واقع هزینه تیم سبدگردانی، ارائه خدمات و گزارش در خصوص نحوه مدیریت سرمایه مشتری است. این کارمزد به صورت روزانه محاسبه و در مقاطع ۳ ماهه از مشتری دریافت می‌شود یا از مانده دارایی‌های وی نزد شرکت سبدگردان کسر می‌گردد.
بخش متغیر کارمزد، مبلغی است که سبدگردان به واسطه عملکرد خود دریافت می‌کند و این کارمزد به میزان بازدهی پرتفوی مشتری که توسط سبدگردان مدیریت می‌شود بستگی دارد، این کارمزد از طریق فرمول ذیل محاسبه می گردد.
بخش متغیر کارمزد در واقع حکم پاداش عملکرد شرکت سبدگردان را دارد و تنها در صورتی از مشتری دریافت می‌گردد که بازدهی سبد اختصاصی وی در پایان قرارداد یا به هنگام فسخ آن از جانب وی، بیش از حداقل مقدار تعیین شده و توافق شده در ابتدای قرارداد باشد. نرخ بازدهی مورد نظر و سهم مشتری و سبدگردان از مازاد بازده احتمالی ایجادشده، با توجه به آورده مشتری و در ابتدای قرارداد به صورت توافقی بین طرفین تعیین می‌شود. این نرخ می‌تواند به صورت پلکانی نیز تعیین شود. اما در هر حال، سهم عمده از مازاد بازده ایجادشده، متعلق به مشتری است و سبدگردان تنها بخش کوچکی از آن را به عنوان پاداش عملکرد مطلوب خویش دریافت می‌کند. این امر باعث ایجاد انگیزه در سبدگردان برای کسب بازدهی بیشتر برای مشتری می‌شود. بدیهی است که مقدار مطلق این کارمزد، بستگی زیادی به زمان اتمام یا فسخ قرارداد و شرایط بازار و سبد مشتریان در آن زمان دارد و قبل از آن، قابل اخذ نیست. در ضمن قراردادها معمولاً به صورت یک ساله منعقد می‌شوند و با درخواست مشتریان، قابلیت تمدید دارند.